后来，徐达被调回应天，原本只是暂时领赏休息，但恰好遇到了爪哇北上的事件。在郭康的了解中，徐达本来应该北上返回，然后可能是因为过于劳累，在北平染病，最后在应天不治。但爪哇元突然跳了出来，导致后续一系列事情都受到影响。
在这个世界，徐达之后就没有回去——因为爪哇元动员的“垃圾兵”太多，哪怕主力被击败之后，还有众多海盗盘踞在沿海的岛上。另外，一些豪商的残余势力也不甘心。
可能是知道，自己回去也没用，肯定会被行省里的冷静派挤兑，因此，这些激进派里，好多人干脆就不走了。正好这时候王保保进军倭国，逐渐开始收编四处乱跑的倭寇，他们就背弃了爪哇行省，转而和征东行省联络，从那里讨来一大批没人要的倭人，整日在海边游荡，滋扰沿海百姓。
明朝朝廷原本的思路，是实行海禁。在官军顾及不到，民众也无力自保的地方，索性把沿海地区的居民都迁徙走。因为就官军现在这个三脚猫的海战能力，根本保护不了平民，放这儿也就是被元人随便抓奴隶的。但现在，战争的性质已经发生了变化。这些人从“倭寇”、“海贼”，变成了王保保的下属，有明确靠山和训练来源的正规军。那么，就不能再用对付海匪的方式去思考了。
为此，朱元璋留下了击败爪哇的徐达，任命他主持东南地区沿海防务，率领军民对抗海上进犯。朝廷更多的资源，也开始向这方面倾斜。因为面对元朝正规军的话，只靠躲，那就肯定没用了。由于新的海匪还是有不少倭人，特征很明显，因此这种军事准备，被大家俗称为“备倭”。
在徐达的经营下，经过几年时间的调整、训练，沿海地区的“备倭”状况，有了很大好转。他本人，好像也没有和郭康了解的一样生病。但这样一来，北方就缺少大将主持了。
为此，朱元璋只能改变计划，让朱棣提前顶上。配合朝廷派去的其他将领，参与对东线元军的作战。
由于对前线不太放心，朱元璋专门写了文书，详细解释了自己的战略构思。他认为，纳哈出好对付，但王保保这边就难说了。王保保不救援还好，如果救援的话，前线明军很可能不知道先去做什么了。
所以，他专门解释说，应该以应对王保保所部为最优先，因为他们实力最强。要是置之不理，可能会对明军造成很大威胁。为此，宁可放弃歼灭纳哈出的意图。如果态势比较好，就率领主力，和王保保部决战。如果不好，直接撤回来就行。
他估计，现在王保保刚刚开疆拓土，尤其他控制的还是外藩、王化不普及的地方，急需人手去消化占领区。不管是长期远征，还是骨干士兵大量损失，都会严重影响他开发高丽、倭国的进度。所以王保保那边可能也会很保守，因为他们那边，也完全不值得把主力用在这个方向。
所以，他大概率要放点水，而且肯定要故意让明军“发现”，以便于双方形成默契，在不改变旗号的情况下，依然可以互相“配合”一下。如果真是这么来，那么抓紧时间消灭纳哈出也是有可能的。
当然，这都是他目前的推测，诸将应该以自己观察到的实际军情为准。只是要注意兵法的原则，保持清醒，不要因为任务有两个选项，就总是想要都做了。实在不行，也可以放弃歼灭纳哈出的构想，先撤回来，不要为了这个目标把大军赌上去；更不要左右摇摆，一会儿要去攻坚打纳哈出，一会儿要去野战打王保保。如此以来，才不会出现过于严重的问题。
不过从结果看，他对于手下和儿子还是多虑了。明军实际的表现，比朱元璋预计的还更好。
他们攻打纳哈出的时候，北元方面果然无动于衷，只是忙着应付那边的明军偏师。而主力这边，向东北方向前进的时候，果然和纳哈出遭遇。
这次战斗本身也乏善可陈，甚至都没有多大波折。纳哈出所部溃败之后，余部向西北逃走。朱棣等人审问俘虏，才知道，原来纳哈出最近还跟王保保闹了矛盾……也不知道明军天天盯着各路元友呢，他俩居然还能闹得起来，必须要先内战才说得清的。
王保保所部也做出了反应，但他们现在调集士兵也需要时间。而这次，明军行动实在太快。
元朝方面称，战前，征东行省曾经讨论过，结果是纳哈出再废物，坐拥十余万人，也不是一下能被明军吃掉的——那就算是十多万张烧饼，明军估计得吃一阵子呢。
对此，郭康的感觉是，元朝的烧饼可能还挺大的。不知道当年伯颜囤积的一屋子烧饼，实际上是多少张……感觉他们就跟烧饼过不去了。
此外，明军战略上的机动速度，以及统筹规划，迅速转变战略方向的能力，也超出了征东行省的预期。这次是朱棣第一次参与主持大规模战争，结果就表现优异。他所部的明军两次迅速转场，队伍都没有乱掉，凭借这个能力，截击了王保保军的前锋，败其知院张玉。而发现碰上了硬茬之后，王保保也没有选择莽上去拼一把，反而开始后撤，回避了后续的决战。
看起来，朱元璋的估计没有错误。王保保还是更重视“种田”，宁可去倭人那边经营，也不想在这不确定的地方花费精力了。
战争结束后，朱元璋对于朱棣的表现很满意，专门告诉朱标，说他这个弟弟可堪一用，是个好苗子。在这个世界线，朱棣得到重用，可能就是从此开始的。