于是林长安就以整肃宗教的名义开始对这些寺庙出手，此时在缅甸，寺庙可以说是最大的地主。
在封建统治时期，缅甸的寺庙就占据了大量土地，到了殖民时代同样如此。虽然没有具体统计数量，但是在密支那，各种寺庙基本上占据了三成左右的农田。
并且这些农田全部都是上田，属于肥沃的水浇地。
林长安在均田的时候并没有动寺庙，因为当时底层的民众崇信佛教，他也没有获取底层人的信任。
但是在推行了均田后，他成功获得了大量底层民众的拥护，这个时候再对寺庙的田产进行没收就是水到渠成了。
林长安首先组建了宗教管理局，对宗教进行登记管理，接下来制定了严苛的宗教管理制度，将不合格的寺庙进行取缔，此时的缅甸拥有大小寺庙上万座，这么多寺庙肯定是不行的。
僧人重新进行考核，只有考核通过的才能继续当僧侣，没有通过考核的就必须还俗。
同时将寺庙的土地全部收为国有，只留下五十亩用来自己耕作。
通过审核的寺庙产权收回国家，国家会每年对寺庙进行拨款，以用来修缮寺庙和维持其运行，寺庙只有一个工作，那就是修行。
一开始，林长安的寺庙改革被几乎所有的寺庙抵制，甚至有些寺庙还想要煽动信徒进行闹事，也有一些寺庙以寺庙为他们的私产为由，拒绝国家收回。
林长安可不会惯着他们，直接以非法传教，蛊惑人心，不遵守戒律清规，淫乱寺庙，意图阴谋颠覆政府等名义将这些寺庙直接取缔。
这些寺庙想要煽动信徒用来抵制民族独立政府的命令，虽然成功聚集了一部分信徒，但是在军队一到，立刻就对其进行了抓捕。
数百信徒和所有僧侣被抓捕，林长安对这些人可没有心慈手软。那些敢于响应的信徒全部被没收土地，然后送到农垦兵团去修路，进行劳动教育。
所有的僧侣则是被集中起来，送到矿区挖矿。这些僧侣一天天的念经修行，已经误入歧途，要知道修行不是念经就行了，而是需要切身体会人间疾苦。
只有体会了人间疾苦，才会懂得如何修行，没有体会过这些何来超脱？
同时参与抵制活动的寺庙除了历史悠久，名声大的，其他寺庙全部取缔，即便是那些保留下来的寺庙也都会派驻宗教管理会进行直接管理。
林长安的计划就是将寺庙数量砍到一千座。僧人数量也从数十万降低到五万。林长安命人编纂了《宗教管理条例》，《宗教爱国主义思想教育》等书籍。
并且规定了所有僧侣都必须学习，并且考试。别说是和尚，佛祖来了都要先学习爱国主义教育。
同时对于女尼进行分离管理，让其拥有独立寺庙，不允许僧尼在一处寺庙。