燕帖木儿家族倒台之后，换成那个囤积烧饼的抽象权臣伯颜上台。元顺帝此时就有意任命她作为皇后，但伯颜等人认为，历来皇后都是弘吉剌部的女子，不能破例。监察御史李泌等人也上书，说当年元世祖曾经发誓，不与高丽共事。现在灾异四起，都是阴盛阳衰的表现，说明后宫失去了秩序，因此不能立她。
双方博弈到最后，以元顺帝让步，只封奇氏为第二皇后告终。只不过皇后本身的权力其实还是她的，元顺帝甚至专门改徽政院为资正院，专属奇皇后，将昭功万户府及集庆路钱粮划拨该院，等于直接给了她食邑。权力之大，已经不逊于之前弘吉剌部的人了。
这种情况下，最后的障碍伯颜也倒台之后，奇皇后的地位如日中天，连家族鸡犬升天，也得到了提拔。元廷给她父兄都授予或者追授了官职，拔高他们的地位。连带着和幸州奇氏关系密切的武人，也得以重回高丽王廷中央。
这个时候，奇皇后还在努力经营正经人的形象，积极阅读女经，效仿历代贤明女子的案例，对祭祀非常恭敬，还推崇理学学者，驳斥藏传佛教僧侣。因此，朝廷里支持她的人不少。
为了提高民间声望，奇皇后还派亲信在大都赈灾，给饥民施粥，让心腹太监朴不花收敛大都城里死者的尸体，去专门的墓地安葬。结果，清理尸体的时候，竟然一口气整理出来十多万具。奇皇后等人都大为惊讶，都被吓得有点破防，只能让僧人举办盛大的水陆大会，超度亡灵，来安抚人心。
实际上，大都的情况也不是这时候才出现了。元人早就有诗句感慨，说大都每年冬天都会冻死很多人，但总是又会出现新的乞丐，到处都是，也不知道人口是怎么稳定下来的。
只不过，在中原，这是个非常危险的信号。大量乞丐涌入首都，说明流民的情况已经非常严重了。而按照规律，百姓生活下降，到了一个界限之下，就会出现一批统一着装的农民，四处行凶，斩杀官僚和士绅，在大元也毫不例外——因此也可以叫做“大元斩杀线”吧。
所以，奇皇后等人慌张也可以理解。这明显就是要出大事了……
果然，元朝在地方的统治很快就开始崩溃了。到至正十六年，奇皇后自己的采邑集庆路，也被一个全家死于饥荒、自己成为流浪汉的普通百姓朱元璋攻占了。奇皇后的势力，因此遭遇了很大打击。可见斩杀线在大元还是普遍存在的呢。可能伯颜提前囤积烧饼，就是为了防止自己失业之后被斩杀吧。
看到她和元朝都开始虚弱，高丽王又开始行动。当年，就抓住机会，发动政变，清洗了奇皇后的家族。
奇皇后十分气愤，一直想要找机会报复。为此，元顺帝也扬言要发兵八十万，攻打高丽，帮她报仇。但说归说，元顺帝却根本不动作。于是等不及的奇皇后就和儿子元昭宗一起，联络了落魄的高丽武人崔濡，自己发兵打回去。
这个时候，不少高丽人都同时在朝廷和高丽国内拥有官职，崔濡就是其中之一。这人行事风格非常莽撞无理，在元朝担任御史之后，就回到高丽横行无忌，特别喜欢雷普大臣的妻子。他被任命为佥议参理时，兴海君告诉他：“是我举荐你的。”崔濡居然愤怒起来，说：“我难道还要靠你的力量么？”转头就打了兴海君一拳。他还直接要求国王给自己升官，官员闵思平说：“你是抄人出身，已经升到顶了，还不知足？”崔濡这次都懒得反驳，直接动手殴打闵思平，朝堂上一时打成一片……
由于这种行事风格，大家都不喜欢他。但他有自己的同党，所以也拿他没办法。
那个“抄人”，就是说他所属的派系。权臣崔氏当年组建了自己的私兵，分为左别抄、右别抄及神义军，统称“三别抄军”。在蒙古入侵时，这些武人是反蒙最坚定的势力，崔氏覆灭、高丽投降之后，也不乐意听从蒙元。高丽王下令他们解散，这些人就公然造反，跑到南方的小岛上盘踞。过了一段时间，才被灭掉。但他们的势力，还是没有得到完全铲除。只不过到了元末，武人反而和元廷关系密切，两边调换过来了……
找到将领之后，奇皇后等人又去调兵。但当时，辽阳行省已经被打空了，蒙汉军队一共都不到一万人。没办法，又让崔濡雇佣了一批倭寇，凑够了一万，跨过鸭绿江，向高丽进发。虽然数次击败高丽军队，但高丽朝廷也调动精锐骑兵拦截，最后，崔莹和李成桂等人，靠着平安北道的骑兵，挫败了元军。元军因此大为沮丧，无论如何不乐意进攻，将领们也只能让他们撤回。最后，大军一路溃散，大批追随奇皇后和崔濡的高丽官员被杀，就没剩下几个人跑回去。
这次耻辱性的失败之后，元廷彻底失去了对高丽的影响。崔濡等人仍然不甘心，希望元顺帝继续支持，表示只要能保住高丽的权力，大元要多少钱粮女子，他们就给多少。高丽人如果不够用，他们和倭人关系也不错，可以在庆尚、全罗地区，设置倭人万户府，把这些地方给倭人，换取倭人也来保卫大元。
只不过，元顺帝一直对这些人观感不好，没有采纳。不久，孛罗帖木儿攻入大都，清算奇皇后党羽。崔濡也被押回高丽处决，他们的行动，算是完全失败了。
等孛罗帖木儿也翻车之后，大元自己都要被斩杀了……元顺帝北逃之后，高丽反而热心起来，积极和元顺帝、包括之后的元昭宗联络，表示自己还是大元忠臣。
这个举动，可能单纯就是他们也害怕明军——毕竟，这会儿大家普遍还是坚持认为，明军就是红巾军的。而高丽，是真的见识过红巾军。不过，他们的行动，也就是说说而已，其实也没有真正行动起来，给大元分忧。
在这种错综复杂的背景下，如何利用高丽，也是元廷的难题之一。当然，反过来，高丽的本地势力，也试图通过元军，实现自己的政治目标。
王保保东进的时候，高丽内部，传统的武人力量经过多轮清洗，已经元气大伤，很难成气候了。不过，新的武人阶级，却开始崛起，并且和之前一样，开始受到文官和老贵族的打压。这种故事一看就似曾相识，于是，王保保马上有了数，一边驻军准备，一边和新崛起的高丽武将李成桂取得了私下联系。