菲律宾事宜一切结束，威莱率部队离开菲律宾返回新几内亚已经是五月末的时候。
在第二阶段到现在也已经有着两个多月的时间，在这两个多月内，不仅是菲律宾军队在强大的攻势下战败，远在南非的布尔人也遭受着同样的命运。
自3月13日下午，英军开入布隆方丹以来。
3月中下旬，由于英军部队伤寒流行，这群来自全球各地的人们实在无法快速适应南非的环境，罗伯茨不得不下令就地休整，英军的攻势被迫中断。
3月26日，布军总司令茹贝尔在柳树农庄战斗中再次坠马重伤，布尔人的不幸接踵而至，这位率领布尔军队数次抗击英国人的名将最终在3月27日去世。
根据他的遗愿，擅长游击战的路易斯·博塔继任布尔野战部队总司令，布尔人也同样清楚英军的实力越发强大，布尔的国力却逐渐微弱，不打游击实在没有办法与英国人继续正面对抗。
天不随人愿，如果英国保持二十多万人的规模，布尔人依靠数万活跃在南非土地上的军队，加上列强偷摸的支援，也许还能周旋一二。
只可惜在1900年4月底，又有一大批英国援军开到南非。
经过兵力调整，在主攻方向上，罗伯茨有八个步兵师，第3、6、7、8、9、10、11师、殖民地师和第12骑兵师。
经过恢复，大批英军从伤寒中得以痊愈，罗伯茨决定英军在5月初重新发动进攻。
5月12日，罗伯茨的大军攻克奥兰治自由邦的新首都克龙斯塔德。由于接连遭到失败，布尔人的士气一落千丈。
为抵消游击队对英军补给的影响，在罗伯茨的许诺下，许多在英军后方活动的民团团员向英国人投降，交出武器，然后返回自己的农场。
和西班牙在菲律宾面对的问题不同，英军是处于完全压倒的存在，很多布尔人认识到无力回天。
而西班牙军队一不能有绝对实力压倒菲律宾军队，二西班牙政府吝啬的不愿意给予菲律宾人任何承诺，这也是西班牙会打的如此艰难的原因之一。
直到5月中旬，仍在战斗的布尔人只剩下了两万多人。
和一开始，布尔人声势浩大的战争，七八万人活跃在战场上，只能说所有人都知晓布尔人已经步入末路。
布尔人不是没有向各国求援，在战争爆发的期间，克鲁格一直有派出使者寻访各国。维托里奥就不下五次接见过布尔使者，但各国面对布尔人的诉求或者说是祈求，只能顾左右而言他。
英国为一举解决布尔人这个隐患，已经向南非投入三十多万军队，大家都看出英国动真格的了。没有哪个国家希望真正得罪死英国，自然面对布尔使者时，也就只能一定程度上给予一些武器装备算作鼓励。
1900年5月24日，米尔纳勋爵在布隆方丹宣布英国兼并奥兰治自由邦。吞并奥兰治后，英军加紧向德兰士瓦进攻。
5月29日，弗兰奇将军指挥澳大利亚骑兵部队，在约翰内斯堡南郊的克利普河击败了布尔人的最后一支防御部队。