却说敖徒令人将药师佛擒住，问他来历。
药师佛道：“我是来为大王治病的，大王何必追问来历。”
敖徒道：“我乃先天之圣，与天地同生，日月同长，有何疾病？”
药师佛道：“大王虽无疾病，却有杀劫临身。”
敖徒道：“好个妖僧，竟敢放此妖言。你且说说我有什么杀劫，若是稍有差错，我就将你杀了。”
药师佛道：“大王蒸杀四佛，抢夺宝旗，囚禁观音、文殊、普贤三位菩萨，阻拦取经大势。天数有六，大王见罪有五，还不是杀劫临身而不自知吗？”
敖徒笑道：“既然如此，你有何法治之？”
药师佛见敖徒面带笑意，叹气道：“大王杀劫临身，仍旧以为笑谈，想必是不信我之良言了。”
敖徒道：“不知你的良言是什么？”
药师佛道：“自然是请大王送还四佛躯壳，交回宝旗，放了三位菩萨，不再阻拦取经，如此方可得救。”
敖徒笑道：“和尚，你有良言送我，我却也有良言送你。”
药师佛问道：“是何良言？”
敖徒道：“我与你无冤无仇，你回你的东方净琉璃世界念经去，再不要来我这西方娑婆世界。日后我占了灵山，还请你来做礼拜法事，岂不是好事？倘若稍有一个不字，我就打死你，让你替如来和尚入劫去也！”
药师佛听了，心知敖徒已看破他的来历，也不再隐藏，化作本相，手持药师葫芦，道：
“施主，恕难从命！”
敖徒道：“可怜，我本与你无仇，奈何你执迷不悟，如今只能杀你。”
言罢，二人再不多说，战在一起。
敖徒抬手放五色神光，须臾将药师佛刷了进去。
药师佛在五色神光中现出琉璃金身，内外澄澈，不受侵扰。又现出一方东方净琉璃世界，乃是药师琉璃光佛的根本道途，背负在身后。
那方世界，无三恶道、无病痛、无贫苦，大地、宫殿、器具皆由琉璃七宝合成，光明恒常，昼夜无别；国中众生身心康健，安乐修行，不受世间生老病苦。
敖徒用五色神光困了这方世界三天，难破药师佛的琉璃金身，消耗太重，遂将其放了出来，抛在城外。
药师佛盘坐虚空，诵十二本愿，现十二护法大将，各率七千药叉，攻杀而来。
敖徒一声令下，众妖齐出，蝎子精见面蛰倒一个。
药师佛从药师葫芦里倒出一颗琉璃金丹，又叫大宝琉璃药，吹了一吹，那被蛰倒的护法大将便又站了起来。
敖徒见了，上前攻打药师佛。
先过了几招拳脚。
那药师佛没什么武艺，但琉璃金身实在厉害，敖徒难以打破。
敖徒于是也不留手，右手掐诀，七窍中喷出六丁神火来烧药师佛。
药师佛合掌伫立，用琉璃金身勉强抗住。敖徒又吐出一口大日真火，将其手上金身烧裂一块。药师佛手上血肉瞬间化作飞灰。
药师佛就将药师葫芦倾倒，倒出一颗琉璃金丹，那药丹围着他的手上转了转，手顿时好了。
敖徒暗道厉害，又将混元金斗祭出，撞了药师佛一下，药师佛一个趔趄。